Nach der Grundschule in Imbro besuchte er das Gymnasium Zografeio von Istanbul (das antike Konstantinopel). Er begann das Theologiestudium an der Fakultät von Chalki mit dem Abschluss magna cum laude in Theologie.

Diakonenweihe am 13. August 1961. Von 1961 bis 1963 leistete er Militärdienst, von 1963 bis 1968 konnte er mit einem Stipendium an orientalischen Institut der Gegoriana-Unviersität in Rom die Studien fortsetzen und spezialisierte sich weiter am Ökumenischen Institut von Bossey in der Schweiz und an der Universität München. Die Doktorarbeit verfasste er über die Abfassung der Canones und kanonischen Dekrete in der orthodoxen Kirche. Er spricht Griechisch, Türkisch, Latein, Italienisch, Französisch, Englisch und Deutsch.

 

Nach der Rückkehr nach Istanbul wurde er 1968 zu Vize-Rektor der theologischen Fakultät von Chalki ernannt. Priesterweihe am 19. Oktober 1969. Schon sechs Monate später wurde er vom Ökumenischen Patriarchen Athenagoras von Konstantinopel zum Archimandriten ernannt.

1973 wurde Bartholomäus vom neuen Ökumenischen Patriarchen Dimitrios zum Direktor des neu geschaffenen Patriarchenbüros ernannt und 1990 zum Metropoliten von Chalcedon gewählt. Von 1974 bis zur Wahl zum Patriarchen 1991 war er Mitglied der Heiligen Synode und in verschiedenen synodalen Kommissionen. 1990 wurde er Metropolit von Chalcedon und am 22. Oktober 1992 nach dem Tod von Demetrios zum Erzbischof von Konstantinopel und Ökumenischen Patriarchen gewählt, am 2. November des Jahres übernahm er das Amt.

 

Am 16. April 2016 besuchte er mit Papst Franziskus und dem Erzbischof von Athen und ganz Griechenland Hieronymus das Flüchtlingslager Moria auf der Insel Lesbos, um die Öffentlichkeit für das Problem der Flüchtlinge zu sensibilisieren. Die drei christlichen Führer unterzeichneten auch eine gemeinsame Erklärung.